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A Study on Attractors of Generalized Asynchronous Random Boolean Networks Um estudo sobre atratores de redes booleanas aleatórias assíncronas generalizadas

Van Giang TRINH, Kunihiko HIRAISHI

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Resumo:

Redes booleanas (BNs) são consideradas modelos formais populares para a dinâmica de redes reguladoras de genes. Existem muitos tipos diferentes de BNs, dependendo de seu esquema de atualização (síncronos, assíncronos, determinísticos ou não determinísticos), como Redes Booleanas Aleatórias Clássicas (CRBNs), Redes Booleanas Aleatórias Assíncronas (ARBNs), Redes Booleanas Aleatórias Assíncronas Generalizadas ( GARBNs), Redes Booleanas Aleatórias Assíncronas Determinísticas (DARBNs) e Redes Booleanas Aleatórias Assíncronas Generalizadas Determinísticas (DGARBNs). Um importante comportamento de longo prazo dos BNs, o chamado atrator, pode fornecer informações valiosas sobre a biologia de sistemas (por exemplo, as origens do câncer). No artigo anterior [1], estudamos propriedades de atratores de GARBNs, suas relações com atratores de CRBNs, também propusemos diferentes algoritmos para detecção de atratores. Neste artigo, propomos um novo algoritmo baseado na verificação de modelo limitado baseado em SAT para superar problemas inerentes a esses algoritmos. Resultados experimentais comprovam a eficácia do novo algoritmo. Mostramos também que estudar atratores de GARBNs pode abrir caminhos potenciais para estudar atratores de ARBNs.

Publicação
IEICE TRANSACTIONS on Fundamentals Vol.E103-A No.8 pp.987-994
Data de publicação
2020/08/01
Publicitada
ISSN online
1745-1337
DOI
10.1587/transfun.2019EAP1163
Tipo de Manuscrito
PAPER
Categoria
Ciência de Sistemas Matemáticos

autores

Van Giang TRINH
  the Japan Advanced Institute of Science and Technology
Kunihiko HIRAISHI
  the Japan Advanced Institute of Science and Technology

Palavra-chave